Saltar al contenido

BIOC218 Biología Molecular Computacional

Esta conferencia fue archivada desde el 30 de noviembre de 1998

Palabras clave:

BIOC218 Biología Molecular Computacional
BIOC218 Biología Molecular Computacional

¿Por qué es importante el acoplamiento, clases de estudios de acoplamiento, Lenhoff, emparejamiento de superficies, identificación de cavidades, distribución de muestras

Video de acoplamiento

Fuente de video

Miércoles 24 de noviembre de 1999

Palabras clave:

Orador invitado: Scott C. Schmidler

start_marker_tablePliegues de proteínas y superposición de estructuras de proteínas, tamaño del PDB, tareas, visión general, clasificación de estructuras de proteínas, clases de estructuras de proteínas, un problema conceptual, pliegue contra topología, pliegues de la base de datos, automatización de la clasificación de estructuras y detección de pliegues, Algoritmo de Orientación Absoluta, Algoritmos para la Superposición de Estructuras, DALI, ESTRUCTAL, Herramienta de Búsqueda de Alineación de Vectores Vastas, Algoritmos para la Superposición de Estructuras, Creación de Vectores de Estructuras Secundarias LOCK, Comparación de Vectores de Estructuras Secundarias, Alineación de Vectores de Estructuras Secundarias, Paso 1: Superposición Local de Estructuras Secundarias, Paso 3: Superposición de Núcleos, Búsqueda LOCK PDB: Mioglobina, Búsqueda LOCK PDB: Hélice-Tum-Hélice, 3dBúsqueda, Demostración, Pliegues/Arquitecturas

Fuente de video

Lunes 22 de noviembre de 1999

Palabras clave:

Orador invitado: Scott C. Schmidler

start_marker_tablePredicción de la estructura secundaria de la proteína, Abstracción del problema, predicción 2D, predicción Chou-Fasman, GOR, PHD, proteínas de transmembrana helicoidal, Predator, SSPAL, Hidrolasa, Segmentación Bayesiana de la Estructura Secundaria de la Proteína, Modelo Probabilístico y contactos 3D

Fuente de video

Miércoles 17 de noviembre de 1999

Palabras clave:

Orador invitado: Scott C. Schmidler y Jun S. Liu

start_marker_tableOutline, Alineación de secuencias, Modelos estadísticos, Distribución Multinomial, Alineación de motivos, Desplazamiento de fase, Fragmentación, Monitoreo de convergencia y algoritmo PROBE

Fuente de video

Lunes 15 de noviembre de 1999

Palabras clave:

Orador invitado: Thomas D. Wu, M.D., Ph.D.

start_marker_tableMatrices de puntuación probabilística, Búsqueda de similitudes (BLAST, FASTA), Bloques de alineación, Análisis de secuencias basado en patrones, Dos formas de representar patrones, Enfoques básicos, Enfoque basado en puntuaciones, Enfoque basado en frecuencias, Estimación de parámetros, y Seudocuentas

Fuente de video

Miércoles 10 de noviembre de 1999

Palabras clave:

Orador invitado: Russ Altman

Estructuras, ejemplo de enzimas de proteasa serina, motivo de la secuencia, motivos 3D, ejemplo gráfico radial, prueba de significación, análisis radial vs. orientado, sitio de unión del calcio, anotación automática de nuevas estructuras y arreglos de propiedades

Por favor, sigan al profesor mientras navega por las páginas web. Gracias.

Fuente de video

Lunes 8 de noviembre de 1999

Palabras clave:

Modelos de Markov, Patrones de PROSICIÓN, Ventajas de eMOTIF, Evaluar eMOTIFS, Encontrar eMOTIFS, Identificar la función de las proteínas, ORFs, PSI-BLAST, y eBLOCKS

Por favor, sigan al profesor mientras navega por las páginas web. Gracias.

Fuente de video

Miércoles 3 de noviembre de 1999

Palabras clave:

Múltiples representaciones de secuencias, comparaciones de matrices de puntos, residuos y motivos conservados, probabilidad de trillizos de aminoácidos x, PPY, firmas de bloques, transferencias, impresiones, bloques+, programación dinámica, enhebrado, pliegues y secuencias

Por favor, sigan al profesor mientras navega por las páginas web. Gracias.

Fuente de video

Miércoles 3 de noviembre de 1999

Palabras clave:

Múltiples representaciones de secuencias, comparaciones de matrices de puntos, residuos y motivos conservados, probabilidad de trillizos de aminoácidos x, PPY, firmas de bloques, transferencias, impresiones, bloques+, programación dinámica, enhebrado, pliegues y secuencias

Por favor, sigan al profesor mientras navega por las páginas web. Gracias.

Fuente de video

Lunes 1 de noviembre de 1999

Palabras clave:

Método para determinar filogenias, propiedades de los árboles, evolución ortóloga, duplicación de genes, conversión de genes, tasas variables de mutación, árboles de distancia, árbol de tres hojas y cuatro especies, topologías, UPGMA

Por favor, sigan al profesor mientras navega por las páginas web. Gracias.

Fuente de video

Miércoles 27 de octubre de 1999

Palabras clave:

Objetivos de la alineación de secuencias múltiples, EMOTIF, firmas de bloques para una familia de proteínas, modelos de Markov ocultos, alineación de tres proteínas, mapeo de palabras k a números, alineación progresiva, secuencias de entrada, ClustalW y MACAW

Por favor, sigan al profesor mientras navega por las páginas web. Gracias.

Fuente de video

Lunes 25 de octubre de 1999

Palabras clave:

Problema de alineación de secuencias, Algoritmo Needleman-Wunsch, El enfoque paramétrico, Algoritmo de alineación subóptima, Citocromo C vs Citocromo C551, Virgon & Argos, Método de Zuker, Regiones variables de inmunoglobulina

Por favor, sigan al profesor mientras navega por las páginas web. Gracias.

Fuente de video

Miércoles 20 de octubre de 1999

Palabras clave:

Búsqueda de similitudes rápidas, BLAST versus Smith & Waterman, Consultas de ADNc, GAPPED BLAST, PSI-BLAST Alignmnet, Motor de búsqueda de descifrado, Característica receptor-operador

Por favor, sigan al profesor mientras navega por las páginas web. Gracias.

Fuente de video

Lunes 18 de octubre de 1999

Palabras clave:

Redundancia en las secuencias genómicas y de proteínas, alineación de secuencias, búsqueda de la homología de Smith-Waterman, requisitos de tiempo y espacio de la computadora, mejora de Gotoh, FastA, algoritmo BLAST, consultas de ADN

Por favor, sigan al profesor mientras navega por las páginas web. Gracias.

Fuente de video

Miércoles 13 de octubre de 1999

Palabras clave:

Alineación de secuencias, matriz de puntos de ADN, algoritmo Needleman-Wunsch, mutaciones de puntos aceptables de Dayhoff, comparación de matrices de puntuación, algoritmo Smith-Waterman, ALION, programa Gap

Por favor, sigan al profesor mientras navega por las páginas web. Gracias.

Fuente de video

Lunes 11 de octubre de 1999

Palabras clave:

Análisis de Secuencia Paramétrica, Parámetros de Protscale, Flexibilidad de la Cadena de Proteínas, Hélice-Giro-Hélice, Matriz de Peso, Método Perceptrón, Firmas de Bloque, eMATRIX, SEQWeb

Por favor, sigan al profesor mientras navega por las páginas web. Gracias.

Fuente de video

Miércoles 6 de octubre de 1999

Palabras clave:

Un motivo típico, Patrones de PROSICIÓN, Patrones de desarrollo, Búsquedas de cuerdas, Boyer Moore, Complejidad computacional, El código genético, Símbolos de la UIQPA, Sintaxis de expresión regular, eMOTIF, ORFs & ESTs en Proteomas

Por favor, sigan al profesor mientras navega por las páginas web. Gracias.

Fuente de video

Lunes 4 de octubre de 1999

Palabras clave:

Base de datos GenBank, Gestión GenBank, DDBJ/EMBL/Tabla de características de GenBank, Entrada GenBank/DDBJ, Base de datos de estructuras, Programas de conversión de formatos de secuencias, SEQWeb

Por favor, sigan a la profesora mientras navega por las páginas web. Gracias.

Fuente de video

Miércoles 29 de septiembre de 1999

Palabras clave:

Aplicaciones de Internet, evolución de Internet, tráfico de la WWW, infraestructura mundial de Internet, problemas emergentes, redes y capas

Por favor, sigan a la profesora mientras navega por las páginas web. Gracias.

Fuente de video

Lunes 27 de septiembre de 1999

Palabras clave:

BIOC 218: Janet Morrison, MEDLINE, Encabezamientos de Materia, Tesauro MeSH, Bootstrap, Acceso al TEXTO COMPLETO y Revistas Electrónicas

Attn: Las diapositivas del navegador no fueron capturadas. Por favor, sigan a la profesora mientras navega por las páginas web. Gracias.

Fuente de video

Miércoles 22 de septiembre de 1999

Palabras clave:

Programa, disponibilidad y requisitos del curso, bioinformática, algoritmos, genómica, paradigma central, Smith-Waterman, EMOTIF

Attn: Las diapositivas del navegador no fueron capturadas. Por favor, sigan al profesor mientras navega por las páginas web. Gracias.

Fuente de video